شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری DNA

نویسندگان

  • اولاد, غلامرضا
  • بسطامی نژاد, صیاد
  • زالی, حکیمه
  • سلیمیان, جعفر
چکیده مقاله:

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری DNA از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیانی هزاران ژن را به طور همزمان مورد بررسی قرار داده و یک تصویر کلی از فعالیت رونویسی سلول د رشرایط چندگانه فراهم می کند. میکرواری دری را به روی قلمروی جدید جستجوهای بیولوژیکی شامل توضیح ژنها در فرایندهای ویژه مانند چرخه سلولی ، رشد و پیشرفت سلولی، ارزیابی اثر اختلالات شیمیایی و ژنتیکی و شناسایی ژنهای مرتبط با انواع بیماری ها فراهم نموده است. حجم خالص داده تولید شده به وسیله مطالعات میکرواری نیاز به پیشرفت ابزارهای کامپیوتری آنالیز آماری پیشرفته است .در این مطالعه به مرور روش های آماری که برپایه تئوری گراف است پراخته شده است. ساختن شبکه های بیانی ژن (GCN)، ادغام GCN با دیگر داده ها، آنالیز GCN ها و کاربرد GCN برای مطالعه سرطان به طور کامل مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت می توان گفت که مطالعه ژنوم از طریق میکرواری شامل نمونه های بیشتر و در طیف وسیعی از گونه ها امکان پذیر است و در آینده کاربرد روش های متا آنالیز برای ادغام حجم بزرگی از داده ها مانند هم ترازی شبکه ای احتمالا کمک به روشن ساختن مشابهت و تفاوت بین طیف وسیعی از گونه ها ،بافت ها و حالتهای بیماری خواهد شد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری dna

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری dna از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

متن کامل

آنالیز بیان ژن داده های ماکرواری بیماری لوکمیا با برنامه DAVID

چکیده مقدمه: سرطان خون یا لوکمیا بیماری پیشرونده و بدخیم اعضای خون ساز بدن است. ناهنجاری ‌های ژنتیکی نقش بسیار مهمی در رشد لوکمی در بدن دارد. مطالعات زیادی پیرامون کشف عوامل ملکولی درگیر در این بیماری صورت گرفته است یکی از حوضه های دانش جدید در کشف بیان ژن ها در حالت بیماری استفاده از تکنولوژی ماکرواری است که یک تصویر کلی از میزان بیان ژن را در سایز بزرگ ژنومی ارائه می کند. در واقع با بررسی ت...

متن کامل

آنالیز بیان ژن داده های ماکرواری بیماری لوکمیا با برنامه david

چکیده مقدمه: سرطان خون یا لوکمیا بیماری پیشرونده و بدخیم اعضای خون ساز بدن است. ناهنجاری های ژنتیکی نقش بسیار مهمی در رشد لوکمی در بدن دارد. مطالعات زیادی پیرامون کشف عوامل ملکولی درگیر در این بیماری صورت گرفته است یکی از حوضه های دانش جدید در کشف بیان ژن ها در حالت بیماری استفاده از تکنولوژی ماکرواری است که یک تصویر کلی از میزان بیان ژن را در سایز بزرگ ژنومی ارائه می کند. در واقع با بررسی تعدا...

متن کامل

یک الگوی چند متغیری بیزی برای شبکه های ژنی

روش های استنباط متعددی برای شبکه های ژنی وجود دارد، ولی در همه آن ها تنها از اطلاعات نمونه استفاده می شود و کمتر مواردی وجود دارد که از اطلاعات گذشته یا اطلاعات موازی استفاده شده باشد. در این پژوهش به استنباط بیزی شبکه های ژنی پرداخته می شود. تلاش می شود از اطلاعات موجود در قالب یک الگوی بیزی استفاده شود. بدیهی است با به کارگیری توزیع پیشین مناسب و توجه به عدم استقلال پارامترهای موجود در شبکه ه...

متن کامل

یک مدل بازی مشارکتی برای تحلیل داده های بیان ژنی آزمایش ریزآرایه

فناوری ریزآرایه یک ابزار تحلیلی کوچک است که به کمک آن می توان بیان ده ها هزار ژن را، به طور همزمان مورد کاوش قرار داد. سوال عمده مورد بحث در ریزآرایه ها، چگونگی انتخاب مارکرهای ژنی می باشد، تشخیص مارکرهای ژنی می تواند تشخیص زودتر، درمان و پیش بینی دقیق تر نتیجه بیماری ومتعاقب آن استفاده از درمان های مناسب وکاهش هزینه ها را در پی داشته باشد.با استفاده از نظریه های آماری برای پردازش داده های ریزآ...

متن کامل

فرمول بندی شبکه برای آنالیز سیستم های نیروی برق

در این مقاله خلاصه ای از عملیا ت مقدماتی ماتریسی بمنظور آنالیز سیستم های قدرت با استفاده از کامپیوتر عرضه خواهد شد . مطالب مورد بررسی عبارتند از شبکه پرمتیو ، وپولوژی شبکه های الکتریکی ، تبدیل مختصات ماتریسهای ادمیتانس شمش و امپدانس شمش ، ماتریسهای امپدانس حلقه و ادمیتانس حلقه و توضیحات تکمیلی .

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 20  شماره 5

صفحات  129- 137

تاریخ انتشار 2013-03

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023